ความก้าวหน้าในการประยุกต์เทคนิคทางโปรตีโอมิกส์สำหรับจุลชีววิทยาในอาหาร
By: Assistant Professor Jitsiri Rachtanapun., Ph.D.
Department of Food Science and Technology
Faculty of Agro-Industry
Kasetsart University
chitsiri.t@ku.th
เทคโนโลยีด้านการวิเคราะห์โปรตีน (Proteomic-based) มีความก้าวหน้ามากขึ้น และมีบทบาทในงานด้านจุลชีววิทยาเพิ่มขึ้น โดยบทความนี้จะนำเสนอเนื้อหาเกี่ยวกับเทคโนโลยีการวิเคราะห์โปรตีนขั้นสูง ได้แก่ MALDI-TOF MS และ FTIR ที่ใช้ในงานจำแนกชนิดจุลินทรีย์ การประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมอาหาร และความก้าวหน้าในงานวิจัยด้านจุลชีววิทยาอาหาร
Technological advancements involving proteomics based on microbiological analysis have increased. This article aims to present the advanced proteomic-based technologies focusing on MALDI-TOF MS and FT-IR currently applied in the food industry and food microbiology research.
การจำแนกแบคทีเรียด้วย MALDI-TOF MS เป็นเทคนิคที่ใช้เวลาสั้น ระยะเวลาเฉลี่ยนับตั้งแต่การนำโคโลนีของเชื้อบริสุทธิ์จากจานเพาะเชื้อจนได้โปรตีนสเปกตรัมใช้เวลาประมาณ 10 – 20 วินาที หลังจากนั้นใช้เวลาอีกเพียง 15 – 30 วินาทีสำหรับการนำโปรตีนสเปกตรัมไปเทียบกับฐานข้อมูลจนกระทั่งได้ชนิดของแบคทีเรียรายงานออกมา รวมเวลาทั้งหมดแล้วไม่เกิน 5 นาที และมีค่าใช้จ่ายต่ำกว่าการวิธีการจำแนกเชื้อแบบดั้งเดิมประมาณ 7-10 เท่า นอกจากนี้ยังลดการใช้อาหารเลี้ยงเชื้อจึงช่วยรักษาสภาพแวดล้อมอีกทางหนึ่ง
Species identification using MALDI-TOF MS is a highly rapid technique. The average time from picking up the single colony from the cultured media to getting the PMF is approximately 10-20 seconds. After that, it takes about 15-30 seconds to compare the unknown PMF to a set of PMF in a database and get the result of species identification in less than 5 minutes. It is cost-effectiveness 7-10 times lower than the conventional method. Furthermore, it remarkably reduces the amount of microbiological media; thus, it is environmentally friendly.